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张晓鲁教授团队在单细胞研究领域取得新进展

发布日期:2022年09月21日 15:06 点击次数:

[本站讯]近期,基础医学院张晓鲁教授团队联合瑞典卡罗林斯卡医学院李薛鑫研究员在单细胞研究领域取得系列新进展。研究成果先后发表在Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology(中科院一区,IF=9.225)、Nucleic Acids Research(中科院一区,IF=19.160)期刊上。

单细胞技术能够实现在单个细胞水平对基因组、转录组及表观基因组等水平进行检测,分别于2011年及2013年被Nature MethodsScience杂志评为最值得关注的技术。由于其深入到单个细胞的分辨率,单细胞技术对于研究器官发育、复杂器官细胞类型组成以及肿瘤异质性及肿瘤微环境发挥着不可替代的重要作用。在第一项研究成果中,研究团队对肝外胆管癌进行了单细胞转录组测序,鉴定了11个细胞亚型,其中,恶性上皮细胞又可以进一步分为5个亚克隆,并具有明显的病人间异质性。单细胞转录组水平的研究颠覆了以往利用bulk转录组对肝外胆管癌的分子分型。文章第一作者为必威手机登录附属省立医院肝胆外科李洪光医师,通讯作者为必威手机登录基础医学院张晓鲁教授、卡罗林斯卡医学院李薛鑫研究员,必威手机登录为第一及通讯作者单位。

在第二项研究成果中,研究团队汇集了数据库中近3000个单细胞多组学数据,涉及成人及胚胎的19个组织近250万个单细胞,深入整合了数据,并开发了用户使用方便的单细胞多组学数据库网站(www.htcatlas.org),以便用户可以直观直接地找到任意一个组织的单细胞任意组学数据,并可进行自动数据分析及生成。文章第一作者为瑞典卡罗林斯卡医学院博士生潘路,通讯作者为卡罗林斯卡医学院李薛鑫研究员、必威手机登录基础医学院张晓鲁教授,必威手机登录为共同通讯作者单位。

文章链接

1.Single-cell Transcriptomic Architecture Unraveling the Complexity of Tumor Heterogeneity in Distal Cholangiocarcinoma

2.http://doi.org/10.1093/nar/gkac791


【供稿单位:基础医学院    作者:张晓鲁    编辑:新闻网工作室    责任编辑:何语轩 蒋晓涵  】

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